Organik madde, toprak agregatlarının oluşumunda ve korunmasında önemli bir rol oynar. Organik materyaller, mikroorganizmalar ve toprak parçacıkları arasında bağ oluşturur, bu da toprağın daha stabil hale gelmesini sağlar. Özellikle kompost ve yeşil gübre kullanımı, toprağın organik madde içeriğini artırarak agregat yapısını güçlendirir. Zengin organik madde içeren topraklar, daha fazla su tutar ve besin maddelerini daha iyi muhafaza eder. Bu özellikler, bitki sağlığını ve tarımsal üretimi olumlu yönde etkiler. Düzenli organik madde eklenmesi, toprağın yapısal bütünlüğünü korumanın yanı sıra sürdürülebilir tarım için de hayati öneme sahiptir.